Technical bulletin
Vag³Gel(子宮頸部・膣粘液)
ヒト子宮頸部・膣粘液モデル内で常在菌叢または単一株をシリンジ形式で培養し、下流解析用の試料を調製するプロトコル。
Anatomical site
Cervicovaginal
5 mL シリンジ
Product
再現性が高く、かつハイスループットな in vitro モデルは、複雑な微生物コミュニティを研究するうえで不可欠である。本キットは、ヒト子宮頸部・膣粘液を in vitro でモデル化することを目的として設計されている。
本プロトコルでは、シリンジ形式を用いて Vag³Gel 内で常在菌叢や単一株を培養する方法、および下流解析のための試料調製手順を記載する。
Before you begin
- 以下には 2 つの経路を示す。手順 A~C はドナー由来の子宮頸部・膣試料を培養する。単一株を用いる場合は手順 D が A の代わりとなり、その後 B、C をそのまま実施する。
- 本キットのゲルは、ブタ胃由来タイプIIIムチンを排卵期版で 2.4 mg/mL、非排卵期版および妊娠期版で 3.0 mg/mL 含み、NaCl 0.07 mg/mL または MRS 培地を用いる。妊娠期版にはさらにアルブミン 5.0 mg/mL を含む。組成は調整可能である。
- Vag³Gel は好気条件下では主に兼気性嫌気性菌に適しており、特に Lactobacillaceae の培養に推奨される。
- 月経カップを含むすべての器具および消耗品を滅菌し、無菌条件下、理想的にはクラス II バイオセーフティキャビネット内で操作すること。
Procedure
A子宮頸部・膣試料の採取と処理約 75 分
- ドナーが月経カップを 60 分間使用する。回収後、滅菌済み 50 mL チューブに移す。
- カップごと 8,000 × g で 15 分間遠心分離して分泌物を回収し、カップを廃棄する。
- 回収した試料を滅菌フラスコ内で最大 100 mL の滅菌 MRS 培地に再懸濁する。
- フラスコを優しく何度か転倒させ、ピペッティングして均質化する。
Note 月経カップは必ずグローブを着用して取り扱い、事前に 70% エタノールで拭くこと。
Critical 試料はできるだけ新鮮なものを使用し、理想的には採取後 30 分以内に処理を開始し、氷上で保持する。ゲルが MRS 中で製造されている場合は 0.9%(w/v)NaCl で再懸濁する。未使用の試料はグリセロール(最終 10% v/v)を加えて −80 °C で保存できる。
BVag³Gel での培養約 5 分
- シリンジのキャップを外して滅菌状態で保管し、プランジャーを軽く押して最初の 2~3 滴を廃棄する。
- 二重シリンジ混合法を用いて、接種源とゲルを体積比 1:1 で 6~7 回往復させて混合する。
- 接種源とゲルを含むシリンジにキャップを戻す。
- 実験デザインに応じて、37 °C で好気条件下、最大 72 時間培養する。
Note 分子の影響を評価する場合は、二重シリンジ法で添加する前にゲル内で 37 °C、24 時間培養して安定化させる。
Critical 培養前の嫌気条件は必須ではないが、絶対嫌気性菌の損失を防ぐことができる。
Cゲルの溶解1 シリンジあたり約 5 分
- 各試料に Bac³Gel 溶解培地(200 mM クエン酸ナトリウム)を体積比 1:1 で加える。
- ゲルが完全に溶解するまで十分に混合する。均質化した試料は下流解析に使用できる。
D単一株を用いる場合約 15 分
- 対象微生物(例:Lactobacillus)を適切な培地で対数増殖期まで培養する。
- 遠心分離して細胞を沈降させ、上清を除去して適切な培養培地で再懸濁する。
- 600 nm における光学密度を測定し、必要に応じて細胞濃度を調整する。
- 手順 B、続いて C に進む。
Critical ゲルが MRS 中で製造されている場合は、細胞ペレットを MRS ではなく 0.9%(w/v)NaCl で再懸濁すること。
Volumes for every plate format
Downstream analysis
シーケンシング
14,000 × g で 5 分間遠心分離し、ペレットを用いて DNA を抽出する。
メタボロミクス
14,000 × g で 10 分間遠心分離し、上清を回収して凍結乾燥する。
代謝活性または光学密度
14,000 × g で 5 分間遠心分離し、上清を除去して 0.9%(w/v)NaCl に再懸濁する。
その他の解析
細胞生存率の評価、フローサイトメトリー、標準的な微生物学的特性評価にも適している。
Troubleshooting
本製品は研究開発目的(R&D)のみに使用してください。
Questions about this protocol
contact@bac3gel.com